工學二部学部成立于2001年，现有生物类、环境类、化工类、數學與應用數學、應用化學、應用物理學等6大学科方向，下设生物工程、生物科学类（含生物科学、生物技术）、食品科学与工程类（含食品科学与工程、食品质量与安全）、環境工程、安全工程、給排水科學與工程、化工与制药类（含化学工程与工艺、制药工程）、药学类（含药学、药物制剂）、數學與應用數學、應用化學、應用物理學等十一个大类专业。学部现有辅导员5名，在校学生1400余人。

工學二部一直秉承“以琢玉之功施教、以成器之心求学”为宗旨的教育理念，在提高学生专业知识水平的基础上，充分发展个性化教育，逐步提升学生的专业技术水平和社会实践能力，培养学生成为高素质的复合型人才。学部多年一直注重学生学术研究和创新精神的培养，结合专业特色，定期举办学术报告会，聘请知名学者、专家来我院讲学；组织学生参与各级各类学科竞赛，多次获得国家级奖项，成绩喜人；重视学生实践能力培养，组织学生积极参与社会实践活动和创新创业活动，获得校内组织和社会外界一致好评。

生物工程

生物科學類：生物科學、生物技術

食品科學與工程類：食品科學與工程、食品質量與安全

環境工程

安全工程

給排水科學與工程

化工與制藥類：化學工程與工藝、制藥工程

藥學類：藥學、藥物制劑

數學與應用數學

應用化學

應用物理學